UBE2B

UBE2B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JAS, 2Y4W, 2YB6, 2YBF
Ідентифікатори
Символи	UBE2B, E2-17kDa, HHR6B, HR6B, RAD6B, UBC2, ubiquitin conjugating enzyme E2 B
Зовнішні ІД	OMIM: 179095 MGI: 102944 HomoloGene: 101298 GeneCards: UBE2B
шифр КФ	2.3.2.23
Онтологія гена
Молекулярна функція	• трансферазна активність; • зв'язування з нуклеотидами; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв'язування з АТФ; • ubiquitin conjugating enzyme activity; • зв'язування з убіквітинпротеїнлігазою;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • replication fork; • HULC complex; • нуклеоплазма; • XY body; • хроматин; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• chiasma assembly; • histone H2A ubiquitination; • negative regulation of cAMP-mediated signaling; • postreplication repair; • убіквітин-залежний протеоліз; • protein K63-linked ubiquitination; • meiotic telomere clustering; • positive regulation of reciprocal meiotic recombination; • protein stabilization; • protein polyubiquitination; • negative regulation of apoptotic process; • in utero embryonic development; • protein monoubiquitination; • sperm axoneme assembly; • cellular response to DNA damage stimulus; • protein K11-linked ubiquitination; • histone lysine demethylation; • protein K48-linked ubiquitination; • GO:0033127, GO:2000281, GO:2000817 regulation of histone modification; • Сперматогенез; • canonical Wnt signaling pathway; • synaptonemal complex organization; • відгук до ультрафіолету; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein autoubiquitination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • Убіквітин-залежний протеоліз; • позитивна регуляція канонічного сигнального шляху Wnt;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7320
	22210
	ENSG00000119048
	ENSMUSG00000020390
	P63146
	P63147
	NM_003337
	NM_009458; NM_001362685; NM_001362686
	NP_003328
	NP_033484; NP_001349614; NP_001349615
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UBE2B (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 312^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTPARRRLM	RDFKRLQEDP	PVGVSGAPSE	NNIMQWNAVI	FGPEGTPFED
GTFKLVIEFS	EEYPNKPPTV	RFLSKMFHPN	VYADGSICLD	ILQNRWSPTY
DVSSILTSIQ	SLLDEPNPNS	PANSQAAQLY	QENKREYEKR	VSAIVEQSWN
DS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

Woffendin C., Chen Z.Y., Staskus K., Retzel E.F., Plagemann P.G. (1991). Mammalian mRNAs encoding protein closely related to ubiquitin-conjugating enzyme encoded by yeast DNA repair gene RAD6. Biochim. Biophys. Acta. 1090: 81—85. PMID 1883845 doi:10.1016/0167-4781(91)90039-O
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. (2005). The human homolog of yeast BRE1 functions as a transcriptional coactivator through direct activator interactions. Mol. Cell. 20: 759—770. PMID 16337599 doi:10.1016/j.molcel.2005.11.012
David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 doi:10.1074/jbc.M109.089003
Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 doi:10.1016/j.molcel.2011.01.024
Miura T., Klaus W., Ross A., Guntert P., Senn H. (2002). The NMR structure of the class I human ubiquitin-conjugating enzyme 2b. J. Biomol. NMR. 22: 89—92. PMID 11885984 doi:10.1023/A:1013807519703